Né en région parisienne, c'est à Toulouse que Mohamed Fofana effectue sa formation et empile de nombreux matches en Ligue 1 durant plusieurs saisons. Le défenseur central met ensuite le cap vers Reims, où il devient un élément important du groupe rémois pendant plusieurs saisons. En 2016, il répond à l'appel du RC Lens. Pas épargné par les blessures, l'international malien n'a hélas pas pu souvent être aligné.